Растения, Паттерны, Фенотипы (3П-ДБ) / Plants, Patterns, Phenotypes (3P-DB)

Назначение - Ресурс по экспериментальным данным о паттернах экспрессии и фенотипическим аномалиям развития корней растений.
Область применения - Генетика развития растения.
Используемый алгоритм - Систематизация данных, основанная на биологических онтологиях.
Функциональные возможности - База данных «3P-DB» предназначена для интеграции данных об экспрессии генов растений разных видов в развитии на молекулярном, тканевом и фенотипическом уровнях. Информационная часть базы данных (БД) «3P-DB» состоит из следующих разделов: БД генов, мутантов и трансгенных конструкций растений разных видов; БД по экспрессии генов растений в норме, при мутациях, в трансгенах и при обработке активными веществами и факторами; БД фенотипических аномалий развития корневых систем; терминологические системы. К терминологическим системам в первую очередь относится онтология развития корневых систем растений, которая состоит из двух контролируемых словарей по: (1) стадиям развития корневой системы и (2) анатомии и морфологии корневой системы. К программным компонентам БД «3P-DB» относятся: система ввода и редактирования, интернет-сайт с системой запросов, веб-интерфейс онтологии развития корневых систем растений.
Инструментальные средства создания - Java, Berkeley DB XML.